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使用者:Lemiku/DNA–DNA 雜交

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DNA DNA雜交 一般指的是 分子生物學 技術,這種技術措施的程度的遺傳之間的相似性池的 DNA 序列。 它通常用來確定 遺傳距離 之間的兩種生物。 這已被廣泛用於 親緣關係分類的。

方法

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DNA的一個有機體的標記,然後混合的未標記的DNA要比反對。 該混合物培育以允許的DNA鏈分離,然後冷卻,形成新的混合動力雙鏈DNA。 雜化的序列具有高度的相似性將更加堅定,並且需要更多的能源,將它們分離的:即它們的獨立時加熱的,在溫度高於不同的序列,這一過程稱為"DNA熔化的"。

評估的熔配置文件的雜交的DNA、DNA雙鏈綁列和混合物被加熱的小步驟。 在每一個步驟,列是用;以序列熔化成為單一鏈和洗掉柱。 氣溫在其標記的DNA下列反映量的相似之間序列(和自雜交的樣本用作一種控制)。 這些結果是結合的程度來確定的遺傳之間的相似性的生物體。

用動物學

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當幾個物種相比,這種方式,似值允許的種類安排在 系統樹;它因此是一種可能的方法進行 分子分類學的。 查爾斯南方 和 Jon Ahlquist,開拓者的技術、使用DNA DNA雜交審查的親緣關係的相關聯的( 南方–Ahlquist分類)和靈長類動物。[1][2]

使用微生物學

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DNA DNA雜交的黃金標準,以區分的細菌菌種的,有一個相似值大於70%的指示所比較的菌株屬於不同的物種。[3][4][5] 在2014年,一個閾值的79%相似曾建議單獨的細菌亞種。[6]

更換通過基因組測序

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批評者認為,該技術是不準確的,為了比較密切相關的物種,因為任何試圖測量之間差別的 直向同源 序列之間的物體是不堪重負的雜交的 旁系同源 列在一個有機體的基因組中。引用錯誤:<ref>標籤中未填內容的引用必須填寫name屬性 DNA測序和計算比較順序現在一般的方法,用於確定遺傳距離,雖然技術仍在使用微生物學來幫助識別的細菌。引用錯誤:<ref>標籤中未填內容的引用必須填寫name屬性

現代的方法是進行DNA DNA雜 的硅 使用完全或部分地 測序的基因組中。引用錯誤:<ref>標籤中未填內容的引用必須填寫name屬性GGDC 開發 DSMZ 是最準確的知的工具,用於計算髖關節發育不良的-類似的價值觀。引用錯誤:<ref>標籤中未填內容的引用必須填寫name屬性 除其他算法的改進,它解決的問題旁系同源序列的通過仔細篩選他們從之間的匹配的兩個基因組序列。

也參看

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參考文獻

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  1. ^ Genetic Similarities: Wilson, Sarich, Sibley, and Ahlquist
  2. ^ C.G. Sibley & J.E. Ahlquist. The Phylogeny of the Hominoid Primates, as Indicated by DNA–DNA Hybridization. Journal of Molecular Evolution. 1984, 20 (1): 2–15. PMID 6429338. doi:10.1007/BF02101980. |author=|last=只需其一 (幫助)
  3. ^ Brenner DJ. Deoxyribonucleic acid reassociation in the taxonomy of enteric bacteria. International Journal of Systematic Bacteriology. 1973, 23 (4): 298–307. doi:10.1099/00207713-23-4-298. |author=|last=只需其一 (幫助)
  4. ^ Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematics. International Journal of Systematic Bacteriology. 1987, 37 (4): 463–464. doi:10.1099/00207713-37-4-463. 
  5. ^ Notes on the characterization of prokaryote strains for taxonomic purposes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2010, 60 (Pt 1): 249–266. PMID 19700448. doi:10.1099/ijs.0.016949-0. 
  6. ^ Complete genome sequence of DSM 30083T, the type strain (U5/41T) of Escherichia coli, and a proposal for delineating subspecies in microbial taxonomy. Standards in Genomic Sciences. 2013, 9: 2. PMC 4334874可免費查閱. PMID 25780495. doi:10.1186/1944-3277-9-2. 

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