原位雜交技術

RNA原位雜交 - KRT5和管家基因在人黑色素瘤FFPE組織切片中明視野和熒光顯微鏡下的可視化圖片

使用ViewRNA FISH Assays在細胞中進行多重RNA可視化

野生型果蠅胚胎在不同發育階段的原位雜交（使用駝背基因的RNA）

原位雜交化學技術（英語：In situ hybridization，縮寫：ISH），簡稱原位雜交，是核酸雜交技術的一種方式。其使用標記的互補DNA，RNA或修飾的核酸鏈（即探針）定位組織的一部分或部分中的特定DNA或RNA序列（即原位）。如果組織足夠小（例如植物種子，果蠅胚胎），也可以定位整個組織，細胞和循環腫瘤細胞。這與免疫組織化學不同，免疫組織化學通常是定位組織切片中的蛋白質。

原位雜交用於揭示特定核酸序列在染色體或組織中的位置，這是理解基因的組織，調節和功能的關鍵步驟。

目前使用的關鍵技術包括：用寡核苷酸和RNA探針（放射性標記和半抗原標記）與 mRNA 原位雜交；用光學和電子顯微鏡進行分析； 整體原位雜交;和熒光原位雜交檢測染色體序列等。

原位雜交技術由Mary-Lou Pardue和約瑟夫·G·加爾發明。

基本原理

兩條核苷酸單鏈片段在適宜的條件下，能形成 DNA-DNA 或 RNA-RNA 雙鏈分子，用帶有標記的 DNA 或 RNA 片段作為核酸探針，與組織或細胞內待測核酸（RNA) 片段進行雜交，然後通過放射自顯影、熒光顯微鏡觀察或酶促底物顯色的方法予以顯示，確定目的基因的 mRNA 的存在與定位情況。