| 呼和浩特市 | |
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| 包頭市 |
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| 赤峰市 | |
| 通遼市 | |
| 烏海市 | |
| 呼倫貝爾市 |
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| 鄂爾多斯市 | |
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| 錫林郭勒盟 | |
| 阿拉善盟 | |
| 興安盟 | |
以上除另有註明的外，均為屬地行政區自治區屬、市（盟）屬公辦高等學校。 ：「雙一流」建設高校； ：原985工程院校； ：原211工程院校； ：原全國重點大學； ：中西部高校基礎能力建設工程院校 本：辦學層次為本科的高校；專：辦學層次為專科的高校；民：民辦高校；獨：獨立學院；成：成人高校；（分）：高等學校的分校或校區，不具備獨立備案資格；（特）：內蒙古科技大學解體後，包鋼、包師、包醫三校成為互不隸屬的獨立法人，但包醫、包師不具有獨立備案資格。 標註斜體的學校目前停止招生，但仍在教育部《全國高等學校名單》中。 截止2017年5月31日，內蒙古自治區有普通高校53所（其中民辦普通高校10所），成人高校2所。 | |