新壁总域
新壁总域 化石时期：
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| 各种真核生物例子 | |
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| Halobacterium，古菌的一属 | |
科学分类 
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| 总域： | 新壁总域 Neomura Cavalier-Smith et al., 2002 |
| 域[1] | |
新壁总域（Neomura）是一个演化支，由古菌域和真核生物域两域生物所组成。这个概念是由2002年被汤玛斯·卡弗利尔-史密斯所提出[2]。他假设新壁总域成员演化自真细菌，其中一个主要的改变是细胞壁的成分以糖蛋白取代肽聚糖。
形态学
[编辑]新壁总域是一个非常繁杂的群体，它含括了所有的多细胞生物，以及大部分的嗜极生物。虽然成员的形态学看起来相当不同，但在分子细胞学领域具有许多相同特征。所有的新壁总域都拥有组织蛋白去帮忙包装染色体，且具有其他类别生物没有的内含子。此类生物都使用因子甲硫氨酸作为蛋白质合成的起始氨基酸（真细菌则使用N-甲酰甲硫氨酸）。另外，所有新壁总域成员具有好几种RNA聚合酶，而真细菌只有一种。
解释
[编辑]关于新壁总域在系统发生树的位置，学界看法不一，但主要可分为两大理论：
三域观点
[编辑]当卡尔·乌斯第一次提出三域系统理论的时候，他相信真细菌域、古菌域，和真核生物域三者同时出现，且在系统发生树中互为姊妹群。但后来许多证据显示古菌和真核生物间的关系比其他细菌更相近。这些证据包含这两域的生物都可使用胆固醇和蛋白酶体等复杂分子。这在大部分的细菌中是没有的，只有新壁总域中才会拥有。种种证据显示，真细菌域和古菌域在演化树应为同一个演化支。因此假说认为自最后共同祖先（LUCA）之后，后代可以分为两大演化支，即新壁总域和真细菌域。
系统发生树观点
[编辑]汤玛斯·卡弗利尔-史密斯和他的合作伙伴，在2002年和之后的论文中提出新壁总域为放线菌门的姊妹群[2]。分子证据包含前述胆固醇和蛋白酶体等复杂分子的合成，合成的分子越是复杂，趋同演化的可能性就越低，除非两个合成途径发生了水平转移，但这种机会并不大，因此学界通常支持两者同源。
| LUCA |
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参见
[编辑]参考文献
[编辑]- ^ 1.0 1.1 Cavalier-Smith T. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol. Direct. 2006, 1: 19 [2017-05-21]. PMC 1586193
. PMID 16834776. doi:10.1186/1745-6150-1-19. （原始内容存档于2019-12-18）.
- ^ 2.0 2.1 Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354 [2017-05-21]. PMID 11931142. doi:10.1099/00207713-52-2-297. （原始内容存档于2017-07-29）.
延伸阅读
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- Cavalier-Smith T. The origin of eukaryotic and archaebacterial cells. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1987, 503: 17–54 [2017-05-21]. PMID 3113314. doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x. （原始内容存档于2013-01-05）.
- Cavalier-Smith T. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. January 2002, 52 (Pt 1): 7–76. PMID 11837318. doi:10.1099/00207713-52-1-7.
- Cavalier-Smith T. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol. Direct. 2006, 1: 19 [2017-05-21]. PMC 1586193 . PMID 16834776. doi:10.1186/1745-6150-1-19. （原始内容存档于2019-12-18）.
- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA. Evidence for a gram-positive, eubacterial root of the tree of life. Mol. Biol. Evol. August 2007, 24 (8): 1761–8 [2017-05-21]. PMID 17513883. doi:10.1093/molbev/msm096. （原始内容存档于2020-06-02）.
- Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. The archaebacterial origin of eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008-12-10, 105 (51): 20356–20361. PMC 2629343 . PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105.
- Cavalier-Smith, T. The Neomuran Revolution and Phagotrophic Origin of Eukaryotes and Cilia in the Light of Intracellular Coevolution and a Revised Tree of Life. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2014-09-02, 6 (9): a016006–a016006. PMC 4142966 . PMID 25183828. doi:10.1101/cshperspect.a016006.